Damit die eigenen Konfigurationen aus der php.ini nach einem Upgrade von PHP nicht verloren gehen, legt man sich eine eigene Konfigurationsdatei an.
vi /etc/php/<VERSION>/fpm/conf.d/local.ini
oder
vi /etc/php/<VERSION>/cli/conf.d/local.ini
Hier kann man dann seine eigenen Anpassungen machen, welche die Standardeinstellungen aus der Standard-php.ini überschreiben.
Bei einem Update von PHP kann man so die local.ini einfach in die neue Verzeichnisstruktur kopieren und hat so seine eigene Konfiguration geladen.
Natürlich nach dem Kopieren den entsprechenen PHP-Daemon neu starten.